Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snw1Q9CSN1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snw1Q9CSN1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snw1Q9CSN1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms