Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRY7

Gdpd1, Lysophospholipase D GDPD1, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd1Q9CRY7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gdpd1Q9CRY7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Gdpd1Q9CRY7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Gdpd1Q9CRY7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gdpd1Q9CRY7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms