Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atp5sQ9CRA7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atp5sQ9CRA7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms