Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nicn1Q9CQM0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nicn1Q9CQM0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nicn1Q9CQM0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nicn1Q9CQM0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.3 ms