Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ89

Cuta, Protein CutA, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CutaQ9CQ89 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CutaQ9CQ89 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CutaQ9CQ89 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CutaQ9CQ89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms