Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg3Q9CPX6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atg3Q9CPX6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg3Q9CPX6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms