Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gtf2a1Q99PM3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf2a1Q99PM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms