Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab27bQ99P58 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab27bQ99P58 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms