Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bco2Q99NF1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bco2Q99NF1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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