Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mrpl43Q99N89 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl43Q99N89 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Mrpl43Q99N89 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms