Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Hdac9Q99N13 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hdac9Q99N13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms