Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Bbc3Q99ML1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Bbc3Q99ML1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms