Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp1b4Q99ME6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp1b4Q99ME6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp1b4Q99ME6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp1b4Q99ME6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms