Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nus1Q99LJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nus1Q99LJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms