Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Abcf2Q99LE6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Abcf2Q99LE6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms