Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmed9Q99KF1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms