Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Higd1bQ99JY6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Higd1bQ99JY6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms