Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW5

Epcam, Epithelial cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpcamQ99JW5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EpcamQ99JW5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
EpcamQ99JW5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms