Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Clstn3Q99JH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Clstn3Q99JH7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms