Protein–RNA interactions for Protein: Q99JF8

Psip1, PC4 and SFRS1-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psip1Q99JF8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Psip1Q99JF8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Psip1Q99JF8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Psip1Q99JF8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms