Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Slc8b1Q925Q3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc8b1Q925Q3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc8b1Q925Q3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms