Protein–RNA interactions for Protein: Q920A5

Scpep1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scpep1Q920A5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Scpep1Q920A5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Scpep1Q920A5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms