Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR1

Rab4b, Ras-related protein Rab-4B, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4bQ91ZR1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rab4bQ91ZR1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab4bQ91ZR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms