Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx4Q91YJ2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Snx4Q91YJ2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Snx4Q91YJ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms