Protein–RNA interactions for Protein: Q91XA5

Snapc2, snRNA-activating protein complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc2Q91XA5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snapc2Q91XA5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snapc2Q91XA5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc2Q91XA5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc2Q91XA5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc2Q91XA5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snapc2Q91XA5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms