Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ppargc1bQ8VHJ7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ppargc1bQ8VHJ7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.7 ms