Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GcaQ8VC88 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
GcaQ8VC88 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GcaQ8VC88 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms