Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nlrp3Q8R4B8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nlrp3Q8R4B8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nlrp3Q8R4B8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms