Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MyripQ8K3I4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MyripQ8K3I4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MyripQ8K3I4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms