Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trappc12Q8K2L8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trappc12Q8K2L8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trappc12Q8K2L8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms