Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0W3

Rnf208, RING finger protein 208, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf208Q8K0W3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf208Q8K0W3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rnf208Q8K0W3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rnf208Q8K0W3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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