Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pkn3Q8K045 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pkn3Q8K045 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkn3Q8K045 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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