Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Znf628Q8CJ78 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Znf628Q8CJ78 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1098.9 ms