Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rab11fip3Q8CHD8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rab11fip3Q8CHD8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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