Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCB4

Vps53, Vacuolar protein sorting-associated protein 53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps53Q8CCB4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vps53Q8CCB4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps53Q8CCB4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps53Q8CCB4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms