Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Phtf2Q8CB19 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Phtf2Q8CB19 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms