Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trerf1Q8BXJ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Trerf1Q8BXJ2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms