Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTY2

Slc4a7, Sodium bicarbonate cotransporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a7Q8BTY2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc4a7Q8BTY2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc4a7Q8BTY2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc4a7Q8BTY2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms