Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTI9

Pik3cb, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cbQ8BTI9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cbQ8BTI9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cbQ8BTI9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms