Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ3

Dcaf12, DDB1- and CUL4-associated factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf12Q8BGZ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dcaf12Q8BGZ3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dcaf12Q8BGZ3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dcaf12Q8BGZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms