Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vipas39Q8BGQ1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vipas39Q8BGQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vipas39Q8BGQ1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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