Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms