Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Smim19Q80ZU4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim19Q80ZU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms