Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ckap2lQ7TS74 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ckap2lQ7TS74 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ckap2lQ7TS74 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms