Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tnfsf18Q7TS55 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tnfsf18Q7TS55 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Tnfsf18Q7TS55 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnfsf18Q7TS55 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms