Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zranb1Q7M760 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Zranb1Q7M760 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zranb1Q7M760 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms