Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GypcQ78HU7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms