Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcaf3Q6QR59 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tcaf3Q6QR59 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tcaf3Q6QR59 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tcaf3Q6QR59 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tcaf3Q6QR59 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Tcaf3Q6QR59 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tcaf3Q6QR59 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
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