Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx13Q6PHS6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx13Q6PHS6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms