Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CtifQ6PEE2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtifQ6PEE2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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